Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atp8b3Q6UQ17 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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Atp8b3Q6UQ17 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b3Q6UQ17 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Atp8b3Q6UQ17 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Atp8b3Q6UQ17 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Atp8b3Q6UQ17 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp8b3Q6UQ17 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Atp8b3Q6UQ17 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Atp8b3Q6UQ17 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Atp8b3Q6UQ17 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Atp8b3Q6UQ17 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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