Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc85bQ6PDY0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms