Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms