Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mfsd4aQ6PDC8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms