Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhb9Q6PB60 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms