Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC061212Q6P8K3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms