Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam222bQ6P539 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms