Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Podnl1Q6P3Y9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms