Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Asic1Q6NXK8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Asic1Q6NXK8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms