Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms