Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HelbQ6NVF4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms