Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc66Q6NS45 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc66Q6NS45 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms