Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn11Q6J756 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms