Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Tmcc1Q69ZZ6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms