Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms