Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sbno1Q689Z5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno1Q689Z5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms