Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clcn1Q64347 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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Clcn1Q64347 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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Clcn1Q64347 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn1Q64347 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms