Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim24Q64127 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms