Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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