Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lcn3Q62471 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lcn3Q62471 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lcn3Q62471 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lcn3Q62471 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lcn3Q62471 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn3Q62471 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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