Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga3Q62470 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms