Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vil1Q62468 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Vil1Q62468 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vil1Q62468 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vil1Q62468 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vil1Q62468 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vil1Q62468 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vil1Q62468 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vil1Q62468 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vil1Q62468 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms