Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp1Q62442 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms