Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim28Q62318 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim28Q62318 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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