Protein–RNA interactions for Protein: Q62313

Tgoln1, Trans-Golgi network integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgoln1Q62313 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgoln1Q62313 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgoln1Q62313 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms