Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SypQ62277 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SypQ62277 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SypQ62277 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SypQ62277 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SypQ62277 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SypQ62277 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SypQ62277 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SypQ62277 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SypQ62277 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SypQ62277 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SypQ62277 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SypQ62277 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SypQ62277 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SypQ62277 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms