Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms