Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ttf1Q62187 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ttf1Q62187 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ttf1Q62187 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttf1Q62187 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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