Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Rbm38Q62176 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Rbm38Q62176 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rbm38Q62176 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rbm38Q62176 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rbm38Q62176 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Rbm38Q62176 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rbm38Q62176 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rbm38Q62176 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm38Q62176 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rbm38Q62176 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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