Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lrrn1Q61809 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lrrn1Q61809 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lrrn1Q61809 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lrrn1Q61809 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Lrrn1Q61809 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms