Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga6Q61739 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga6Q61739 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms