Protein–RNA interactions for Protein: Q61646

Hp, Haptoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpQ61646 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HpQ61646 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HpQ61646 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HpQ61646 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HpQ61646 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HpQ61646 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpQ61646 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpQ61646 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpQ61646 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpQ61646 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpQ61646 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpQ61646 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpQ61646 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpQ61646 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HpQ61646 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms