Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms