Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TmpoQ61033 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TmpoQ61033 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms