Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RelnQ60841 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RelnQ60841 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms