Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nr2f1Q60632 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms