Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc1Q60596 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc1Q60596 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms