Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf12Q5SPL2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf12Q5SPL2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms