Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
5730522E02RikQ5SP45 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms