Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm27Q5SFM8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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