Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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