Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xaf1Q5NBU8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms