Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps41Q5KU39 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps41Q5KU39 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms