Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SynaQ5G5D5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SynaQ5G5D5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms