Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ecm2Q5FW85 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm2Q5FW85 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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