Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp22Q5DU02 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp22Q5DU02 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms