Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Defa20Q45VN2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa20Q45VN2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Defa20Q45VN2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Defa20Q45VN2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Defa20Q45VN2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Defa20Q45VN2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Defa20Q45VN2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Defa20Q45VN2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms