Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Snx25Q3ZT31 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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Snx25Q3ZT31 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Snx25Q3ZT31 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Snx25Q3ZT31 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Snx25Q3ZT31 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Snx25Q3ZT31 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Snx25Q3ZT31 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Snx25Q3ZT31 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Snx25Q3ZT31 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Snx25Q3ZT31 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Snx25Q3ZT31 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx25Q3ZT31 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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