Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim26Q3V460 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim26Q3V460 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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