Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc110Q3V125 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms